航管系之願景 (vision) 乃積極結合國內外航空/太空及海運豐盛資源，成為世界有名之空海運專業管理人才訓練學校，培養腳踏實地、品德兼具、具國際競爭能力之基層尖兵，能積極 (proactively) 解決問題貫徹任務並協助達成企業及政府使命。
本系配合政府經貿與航運政策之發展從事教學服務研究，為航空及海運企業及政府管理部門培訓所須知管理尖兵。注意海空運市場目前及未來發展趨勢，加強與航運界之交流合作，掌握市場之快速變化及現代經營管理觀念及方法。
- 配合政府經貿與航運政策之發展從事教學服務研究，為航空及海運企業及政府管理部門培訓所需之航運管理專業基礎尖兵。 注重空海運市場目前及未來發展趨勢，加強與航運界之交流合作，掌握市場之快速變化及現代經營管理觀念及方法。
- 增強學生之國際競爭力，繼續加強與空海航運實務界緊密結合，貫徹本系要求之嚴格無酬實習教育。 本系除全力配合提供實習機會之業界單位當時之需求，共擬一套多元化之輪調(rotation) 實習計畫，使學生能接觸到實務界之多個層面外，並將繼續精心挑選符合業界所需之學生 (即品德優秀、能吃苦耐勞、虛心學習、尊重企業文化、具良好溝通能力、電腦技能、團隊意識及熱忱服務貢獻之精神、並能言行一致達成上級任務要求等) 參與實習，期能貢獻回饋實習單位。 被挑選實習之學生需經職前訓練合格後始能被安排正式上線，並需通過實習單位及本系之嚴格考核標準方得畢業。沒經過上述實習考驗之學生不得畢業。
- 成立空運飛安、法、保及風險管理中心；及海運航安、法、保及風險管理中心。並成立航空服務品質訓練教室，除教導學生追求完美之服務觀念及精神，並要求儀容及談吐等國際禮儀及禮貌；同時要求教育國內乘客搭機時確遵飛安規則，搭機禮儀及禮讓。
- 建立本系物流方面之發展特色，成立航空航材物流中心(Aircraft Spare Parts Distribution and Logistics Center)及海運倉儲及物流中心。除籌設「商管自動化實驗室」外，並與政府於高雄港成立境外轉運、航運中心、及於中正機場成立之航空貨運中心、因應發展全球運籌中心之目標相互配合，以培育出具物流與倉儲管理專業的人才。
- 舉辦多元化之推廣教育，與社會分享教學資源，介紹及探討現代空海營運管理觀念及方法，配合企業達成成長目標，成立航空在職碩士專班 (Aviation EMBA)，飛行學校 (Pilot Training School)，飛機維修管理在職二技專班 (Aircraft Maintenance Management) 等。
- 成立歐洲航太中心 (European Aerospace Center)，引進先進之歐洲航太科技及管理，並與歐洲航太產官學界密切交流，平衡美國航太科技在國內的重大成就，協助國內航太科技突破及發展。從事相關之學術研究，包括加強與國內外學術單位及業界交流、研討問題與解決方法、延攬海內外優良師資或遴聘講座。
課程設計乃迎合國內及國際強烈競爭市場之需求，除提供學生現代基本空海營運管理課程之外，更強調如何做好「被管理」者的角色，確實遵守標準作業程序 (SOP – Standard Operating Procedure)，追求卓越，力求德、智、體、群、美的均衡人格發展，激發學生創造力及獨立思考能力，並深植榮譽、責任、團隊 (team work)、熱忱服務及貢獻的信念，並訓練學生具業界所需之英語聽說讀寫能力及專業溝通和電腦技巧。同時，和業界緊密合作配合實務參訪將理論與實際結合，並邀請實務界菁英至校任教，建立學生與實務界之橋樑，並規定學生需通過業界嚴格之實習合格方得畢業。學生至業界實務參訪及實習，除有助學生提高專業興趣及瞭解實務作業外，也提供學生書本上學不到的知識例如：一架飛機載了數百名乘客起飛並抵達目的地，但背後卻有許多無名英雄在個個崗位上默默且熱誠地為這些乘客的飛安、服務及最佳滿意度做出莫大的貢獻。大學部課程內容包含空海運公權力 (public sectors) 之經營管理及其有關行業 (private sectors) 之經營管理：如航空及海運公司之經營管理、航空站、航運、港埠、物流及倉儲、國際貿易、關稅實務、空海運法規與保險、風險管理與安全管制、市場行銷與服務品質、航運成本與財務規劃、機對規劃及飛機租賃等。同時配合政府航運政策 (如強化飛安、亞太空海運中心、全球運籌中心等) 並融入新科技之發展。
本系著重海空運組之課程與物流管理教學特色之養成，並透過「企業化電子研究中心（RACE）」之籌設，加強與本校相關科系的課程整合。本系教學重點包含八大領域：
- 航運與港埠、機場管理
- 飛航安全、港口保安
- 關稅實務
- 物流管理
- 國際財經、金融、貿易
- 法律與保險
- 國際語文
- 資訊科技與企業自動化領域
配合「商管自動化實驗室」、「航管實務模擬實驗室」之設立，內部規劃陳設機場、港埠及各種相關運輸工具之縮小模型、電腦設備暨相關課程之應用軟體、研討室、以及物流中心雛型之相關軟硬體設備。 計畫成立飛安、法、保及航空服務品質訓練教室，教導學生在實習前已具備追求完美之服務觀念及精神，要求儀容及談吐等國際禮儀，和電話訂位及機場服務之禮貌，使學生在實習期間及畢業後均能符合航空公司提升顧客滿意度、公司形象及國際競爭力之要求。
本系畢業生就業時，可從事航運、船務、航空公司及其有關行業、港埠單位、機場營運、物流業、倉儲業、進出口貿易、報關、空海運保險業、交通事業機構（交通部、航政司、民航局、交通部運輸研究所）、相關運輸事業、貨櫃集散經營業、交通顧問公司、財政部海關與稅務機構、銀行押匯等相關公、民營事業單位工作。 畢業生深造部份，可報考國內研究所或申請國外研究所，包括本校經營管理研究所航運組、航運管理、交通管理（或土木研究所交通組）、國際企業、企業管理、管理科學、國際貿易、工業工程、資訊管理等研究所，以及澳洲 RMIT大學、英國Wales海運大學、美國Embry-Riddle航空大學或哈佛、史丹佛大學等之有關研究所。